123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3303 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  100 
 
 
223 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  89.69 
 
 
223 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  61.01 
 
 
223 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  56.74 
 
 
228 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  60.93 
 
 
228 aa  231  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  60.93 
 
 
232 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  54.35 
 
 
230 aa  221  5e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  48.43 
 
 
223 aa  189  3e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  50.68 
 
 
240 aa  184  1e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  47.96 
 
 
241 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  48.65 
 
 
288 aa  171  7e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  47.09 
 
 
237 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  46.4 
 
 
240 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  45.5 
 
 
309 aa  145  4e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  47.27 
 
 
229 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  46.82 
 
 
224 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  46.82 
 
 
244 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  46.36 
 
 
238 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  40.74 
 
 
214 aa  140  1e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  44.09 
 
 
239 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  42.73 
 
 
250 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  41.47 
 
 
210 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  41.96 
 
 
225 aa  131  7e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  38.14 
 
 
210 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  42.59 
 
 
210 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  42.13 
 
 
210 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  41.67 
 
 
228 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 
231 aa  113  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  42.42 
 
 
231 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  35.19 
 
 
220 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  39.07 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  30.84 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  33.19 
 
 
236 aa  84.3  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
226 aa  79.3  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  33.48 
 
 
236 aa  79.3  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
226 aa  79.3  4e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  31.36 
 
 
228 aa  78.6  6e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  31.28 
 
 
226 aa  78.6  6e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  25.35 
 
 
229 aa  74.3  1e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  29.39 
 
 
224 aa  73.9  2e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
226 aa  73.6  2e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  32 
 
 
226 aa  73.6  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  32.31 
 
 
226 aa  73.6  3e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.65 
 
 
228 aa  72.8  4e-12  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  31.56 
 
 
226 aa  72.8  4e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  31.86 
 
 
226 aa  71.6  9e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  31.86 
 
 
226 aa  71.6  9e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  28.21 
 
 
221 aa  71.2  1e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  24.67 
 
 
232 aa  70.9  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  25.93 
 
 
240 aa  71.2  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  28.24 
 
 
226 aa  70.5  2e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 
226 aa  70.5  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  31.42 
 
 
226 aa  70.1  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  28.88 
 
 
227 aa  69.7  3e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  31.28 
 
 
224 aa  69.7  3e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  30.4 
 
 
224 aa  69.3  5e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  31.63 
 
 
230 aa  68.9  6e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  27.6 
 
 
227 aa  68.6  8e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  32.34 
 
 
230 aa  68.6  8e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
259 aa  68.6  8e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  25.94 
 
 
225 aa  67.8  1e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  32.47 
 
 
226 aa  67.4  2e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  22.79 
 
 
240 aa  67.4  2e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  27.57 
 
 
232 aa  67.4  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  32.07 
 
 
238 aa  67  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  29.82 
 
 
227 aa  67  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 
228 aa  66.6  3e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  31.36 
 
 
229 aa  66.6  3e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  23.89 
 
 
228 aa  66.6  3e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  27.75 
 
 
228 aa  66.2  4e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 
224 aa  65.5  6e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  31.09 
 
 
230 aa  65.1  9e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  30.51 
 
 
229 aa  64.7  1e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  24.64 
 
 
227 aa  64.3  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  33.18 
 
 
224 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  28.63 
 
 
230 aa  62  8e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  27.6 
 
 
223 aa  61.6  9e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  30.18 
 
 
224 aa  60.1  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  29.02 
 
 
224 aa  59.7  3e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  28.25 
 
 
253 aa  59.3  5e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  31.62 
 
 
229 aa  58.9  6e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  28.95 
 
 
224 aa  57  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  31.19 
 
 
224 aa  55.8  4e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  25.64 
 
 
237 aa  55.1  9e-07  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  21.99 
 
 
228 aa  54.7  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  26.01 
 
 
235 aa  53.9  2e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  29.07 
 
 
243 aa  53.9  2e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  26.24 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  30.73 
 
 
224 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  25.59 
 
 
225 aa  53.1  3e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  28.38 
 
 
224 aa  52.8  4e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 
288 aa  52.8  4e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.54 
 
 
230 aa  52.8  4e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  23.94 
 
 
233 aa  52.4  5e-06  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  27.88 
 
 
231 aa  51.6  8e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  21.24 
 
 
228 aa  52  8e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>