More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5969 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  69.84 
 
 		 450 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  95.75 
 
 		 447 aa  895    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 447 aa  927    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  64.81 
 
 		 494 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.23 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  36.82 
 
 		 411 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  35.39 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  36.76 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  34.7 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 		 399 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 		 407 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.87 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  31.27 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  30.26 
 
 		 406 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  32.41 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 		 517 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  30.31 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.91 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 		 367 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 367 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 406 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  27.94 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  28.17 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  36.55 
 
 		 577 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 		 861 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  26.16 
 
 		 1133 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25 
 
 		 701 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  28.8 
 
 		 632 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1130 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  25.6 
 
 		 701 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.96 
 
 		 650 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.51 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 		 858 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 		 859 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 		 641 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  26.73 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  24.49 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  24.49 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 		 651 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 592 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 		 643 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.7 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 		 713 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  26.87 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.45 
 
 		 656 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  24.88 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  23.78 
 
 		 860 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  29.8 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.45 
 
 		 672 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 		 724 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 		 911 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.44 
 
 		 588 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 		 591 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.53 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  31.06 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 553 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  24.19 
 
 		 903 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 		 701 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 		 746 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 712 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  26.76 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  27.05 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  27.81 
 
 		 717 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  25.12 
 
 		 864 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1207 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.43 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>