More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0512 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
250 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  95.2 
 
 
250 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  87.6 
 
 
250 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  82.4 
 
 
250 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  74.6 
 
 
249 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  72.98 
 
 
249 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  72.58 
 
 
249 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  78.63 
 
 
249 aa  374  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  66.94 
 
 
252 aa  343  1e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  65.06 
 
 
250 aa  314  9e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  63.01 
 
 
247 aa  304  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  64.63 
 
 
247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  64.4 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  64.63 
 
 
247 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  62.65 
 
 
248 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  65.31 
 
 
250 aa  298  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  63.41 
 
 
260 aa  297  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  61.63 
 
 
253 aa  297  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  61.04 
 
 
250 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  61.07 
 
 
249 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  58.43 
 
 
258 aa  289  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  60.98 
 
 
249 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  59.35 
 
 
251 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  58.94 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  59.04 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  59.04 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  59.04 
 
 
251 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  58.13 
 
 
251 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  52.46 
 
 
241 aa  254  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  56.39 
 
 
251 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  48.83 
 
 
257 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  44.94 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  46.15 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  43.72 
 
 
243 aa  204  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  44.08 
 
 
282 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  38.46 
 
 
241 aa  197  9e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  45.24 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  46.03 
 
 
260 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  47.35 
 
 
248 aa  191  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  42.35 
 
 
261 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  46.94 
 
 
267 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  43.61 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  44.05 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  44.05 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 
243 aa  177  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  45.33 
 
 
248 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  45.08 
 
 
249 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  36.21 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  38.7 
 
 
285 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  38.71 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  36.12 
 
 
283 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  35.37 
 
 
257 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  36.29 
 
 
263 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.88 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  33.88 
 
 
373 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  39.06 
 
 
265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  32.59 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  33.2 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  34.42 
 
 
267 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  36.5 
 
 
229 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  28.94 
 
 
258 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  35.5 
 
 
229 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  36.36 
 
 
266 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  33.48 
 
 
261 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  34.75 
 
 
281 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  35.32 
 
 
272 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  32.65 
 
 
267 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  35.85 
 
 
263 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 
230 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  32.69 
 
 
234 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  37.38 
 
 
266 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
262 aa  102  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  34.91 
 
 
207 aa  101  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  31.58 
 
 
364 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  31.88 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  34.88 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  32.91 
 
 
283 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.66 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  32.99 
 
 
400 aa  98.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  37.43 
 
 
339 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  37.44 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  31.28 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  34.67 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  33.79 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  33.17 
 
 
280 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.17 
 
 
247 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  33.96 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  28.46 
 
 
345 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.34 
 
 
294 aa  89.7  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  32.64 
 
 
341 aa  89.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 
282 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  32.16 
 
 
355 aa  88.6  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.88 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  35.24 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1515  ATP synthase F0, A subunit  34.32 
 
 
248 aa  87  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  34.6 
 
 
272 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>