More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3163 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  85.06 
 
 
261 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.66 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.85 
 
 
260 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  52.11 
 
 
259 aa  248  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  49.04 
 
 
260 aa  246  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.36 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.98 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.89 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
260 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
260 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  46.54 
 
 
663 aa  236  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
260 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
262 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.19 
 
 
265 aa  232  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  47.41 
 
 
258 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 
260 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.96 
 
 
258 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.9 
 
 
260 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
260 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.81 
 
 
260 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 
260 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
260 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  47.76 
 
 
262 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
258 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  49.62 
 
 
662 aa  219  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  48.85 
 
 
662 aa  219  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.41 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
257 aa  218  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  46.62 
 
 
258 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.62 
 
 
258 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  47.88 
 
 
258 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.51 
 
 
256 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.51 
 
 
258 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  47.55 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
258 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
257 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.07 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
257 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  47.17 
 
 
258 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.04 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  47.92 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.37 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.79 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  44.87 
 
 
257 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  48.47 
 
 
661 aa  211  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.32 
 
 
260 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
256 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  47.71 
 
 
662 aa  210  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
259 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
259 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  45.86 
 
 
258 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
260 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  45.86 
 
 
258 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 
258 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
258 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
257 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
256 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  46.74 
 
 
651 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.21 
 
 
257 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
259 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.21 
 
 
257 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.21 
 
 
257 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
264 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.66 
 
 
257 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.48 
 
 
262 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 
258 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.56 
 
 
258 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.77 
 
 
258 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
257 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 
259 aa  205  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 
259 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  47.19 
 
 
257 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  46.24 
 
 
258 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
258 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  46.59 
 
 
258 aa  204  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.71 
 
 
264 aa  204  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
259 aa  204  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
256 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
258 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>