23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3771 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3771  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00553351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  41.31 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  40.27 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1682  hypothetical protein  40.19 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0975  putative phage repressor  51.2 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  35.94 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3689  putative phage repressor  30.48 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2767  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3423  bacteriophage repressor protein C1  35.48 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3040  putative phage repressor  32.54 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  27.83 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  27.89 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  32.21 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4082  putative phage repressor  31.52 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3576  putative phage repressor  28.23 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6554  putative phage repressor  29.93 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  28.86 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5950  putative phage repressor  29.2 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  38.04 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1954  Phage repressor protein  23.56 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  29.38 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  29.38 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>