293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1132 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  99.25 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  95.9 
 
 		 268 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  73.8 
 
 		 284 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  72.96 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  67.91 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  65.78 
 
 		 292 aa  356  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  61.54 
 
 		 279 aa  353  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  61.17 
 
 		 276 aa  349  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  61.17 
 
 		 279 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  68.28 
 
 		 282 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  63.77 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  61.4 
 
 		 288 aa  341  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  61.45 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  51.43 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  61 
 
 		 283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  61.04 
 
 		 292 aa  303  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  56 
 
 		 272 aa  298  7e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  52.26 
 
 		 305 aa  295  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  54.35 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  51.97 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  54.48 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  53.61 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  52.33 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  52.21 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  52.69 
 
 		 287 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  52.16 
 
 		 287 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  54.84 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  54.84 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  52.99 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  51.75 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  48.48 
 
 		 288 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  48.86 
 
 		 288 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  50.2 
 
 		 284 aa  251  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  45.77 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.77 
 
 		 282 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  42.76 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  45.49 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  52.26 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  48.5 
 
 		 297 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.8 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  44.78 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  48.88 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  43.92 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  48.99 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  50.42 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  44.4 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  48.59 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  43.3 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  43.3 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  43.3 
 
 		 292 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  45.35 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  42.96 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  42.96 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  42.96 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  44.06 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  44.84 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  44.92 
 
 		 318 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  48.72 
 
 		 251 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  43.01 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.73 
 
 		 175 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  41.08 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  56.39 
 
 		 147 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  44.72 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  45.23 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  38.43 
 
 		 229 aa  165  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.04 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  41.7 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  43.37 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  43.22 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  41.33 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  42.78 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  39.82 
 
 		 313 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  36.4 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.3 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  38.03 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  39.3 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  41.41 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  39.3 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  40.82 
 
 		 235 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  39.69 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  41.03 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  41.03 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  41.03 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  41.03 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  40.53 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  41.03 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  36.25 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  38.29 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  46.43 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  42.6 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  42.6 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  40.61 
 
 		 220 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.15 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  40.37 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  40 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  37.72 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  40 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  42.01 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>