255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2862 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  82.4 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  76.17 
 
 		 254 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  76.86 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  76.47 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  76.08 
 
 		 255 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  83.93 
 
 		 254 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  49.04 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  54.02 
 
 		 266 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  49.34 
 
 		 257 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  48.15 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  45.93 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  46.29 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  44.09 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  45.92 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  47.56 
 
 		 275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  41.9 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  41.43 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  42.52 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  42.67 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  42.52 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  41.38 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  42.97 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  40.95 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  38.87 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  37.92 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  36.95 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  36.19 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.68 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  37.99 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  37.99 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  34.55 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  33.46 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  31.84 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  34.51 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  34.66 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  35.8 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.84 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  33.15 
 
 		 211 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  28.69 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  36.65 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  35.96 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  35.39 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  35.26 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  29.64 
 
 		 535 aa  99  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  30.41 
 
 		 222 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 210 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  28.22 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  29.48 
 
 		 207 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  29.48 
 
 		 207 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  29.08 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  28.68 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  29.48 
 
 		 207 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  29.48 
 
 		 207 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  29.22 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 235 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.13 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.13 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  24.71 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 204 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  24.51 
 
 		 294 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  24.51 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.13 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  27.48 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>