273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2624 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  75.42 
 
 		 242 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  70.9 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  72.5 
 
 		 242 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  70.9 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  69.33 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  64.34 
 
 		 243 aa  314  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  56.88 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  57.34 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  57.45 
 
 		 241 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  49.37 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  46.19 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  44.68 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  42.86 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  45.27 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  45.18 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  38.53 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  42.2 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  43.51 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  44.24 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  40.37 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  39.19 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  42.92 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  42.86 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  42.74 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  42.49 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  43.18 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  44.55 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  37.12 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  37 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  39.91 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.68 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  36.68 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  35.81 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  38.29 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  38.12 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.81 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  35.81 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  35.81 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  35.81 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  35.81 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  42.62 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  35.91 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.37 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  42.4 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  45.02 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  44.13 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  42.99 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  42.53 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.53 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.53 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  42.52 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  42.52 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  42.52 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  42.52 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  43.66 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  36.04 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  41.51 
 
 		 215 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  33.02 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  32.41 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  32.41 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  36.48 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  37.07 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  47.67 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  40.18 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  46.51 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  47.16 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  42.72 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  40.81 
 
 		 531 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  43.01 
 
 		 539 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  42.25 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  42.25 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  40.18 
 
 		 218 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  39.27 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  42.79 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  42.79 
 
 		 218 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  38.18 
 
 		 549 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  36.16 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  41.53 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  41.31 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  41.04 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  40.57 
 
 		 553 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  39.02 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  34.91 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  40.82 
 
 		 499 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  38.54 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  38.76 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  35.89 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  38.54 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  38.54 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  38.54 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  38.54 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  38.03 
 
 		 215 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  40.19 
 
 		 539 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  37.86 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  38.54 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  39.05 
 
 		 534 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  38.1 
 
 		 541 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  37.26 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  38.05 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>