More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0470 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  340  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  78.49 
 
 		 195 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  76.54 
 
 		 190 aa  260  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  73.96 
 
 		 190 aa  260  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  75 
 
 		 195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  75.6 
 
 		 167 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  73.62 
 
 		 169 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  56.86 
 
 		 162 aa  170  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  55.84 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  55.84 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  55 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  49.07 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  50.62 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  52.32 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  51.28 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  52.32 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  53.06 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  50.33 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  47.17 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  60.68 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  51.35 
 
 		 159 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  49.03 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  55.2 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  48.73 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  57.72 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  51.16 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  43.98 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  42.47 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  52.8 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  49.68 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  57.25 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  49.6 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  52.03 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  43.04 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  46.15 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  51.72 
 
 		 154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  48.7 
 
 		 200 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  44.58 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  47.5 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  44.22 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  48.84 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  51.61 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  47.93 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  50.85 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  49.59 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  46.09 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  54.24 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  51.61 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  49.66 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  49.15 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  49.15 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  49.15 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  49.15 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  46.72 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  41.98 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  49.14 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  48.31 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  46.55 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  45.31 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  46.03 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  44.9 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  46.03 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  49.14 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  46.28 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  46.55 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  45.69 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  46.22 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  42.64 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  47.41 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  45.21 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  40.52 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.11 
 
 		 255 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  45.3 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  45.69 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  51.61 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  44.07 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  52.03 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  52.03 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  50 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  49.59 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  49.59 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.16 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  47.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  47.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  47.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  47.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  40.88 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  47.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  52.42 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  47.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  47.86 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  45.38 
 
 		 157 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  37.65 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  43.31 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  47.01 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.27 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  47.01 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  39.71 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  41.61 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>