66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4013 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 317 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  88.33 
 
 		 317 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  78.03 
 
 		 317 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  71.02 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  52.48 
 
 		 322 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  53.55 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  55.1 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  52.82 
 
 		 331 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  48.51 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  48.66 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  47.39 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  48.66 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  46.46 
 
 		 342 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.69 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  22.32 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.57 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  26.8 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  25.51 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0185  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  25.85 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  24.51 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  22.55 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  26.02 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  30.77 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.24 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.91 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.65 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 275 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  23.16 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>