225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0497 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  72.51 
 
 
256 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  71.37 
 
 
252 aa  352  3e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  71.37 
 
 
255 aa  348  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  66.53 
 
 
254 aa  338  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  69.35 
 
 
251 aa  334  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  68.67 
 
 
255 aa  318  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  64.9 
 
 
257 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  61.75 
 
 
304 aa  291  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  57.77 
 
 
252 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  60.48 
 
 
254 aa  286  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  57.03 
 
 
253 aa  278  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.17 
 
 
252 aa  275  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  59.27 
 
 
254 aa  273  2e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.4 
 
 
255 aa  271  6e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 
254 aa  270  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  56.8 
 
 
254 aa  269  3e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  56.8 
 
 
254 aa  269  3e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  56.8 
 
 
254 aa  269  3e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  56.97 
 
 
252 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  60.24 
 
 
255 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.06 
 
 
253 aa  258  5e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  58.06 
 
 
250 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  56.35 
 
 
252 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  54.62 
 
 
251 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 
301 aa  254  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  52.78 
 
 
254 aa  253  1e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  55.12 
 
 
256 aa  254  1e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  53.33 
 
 
258 aa  254  1e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  55.06 
 
 
250 aa  251  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  50.8 
 
 
255 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.63 
 
 
258 aa  248  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 
249 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
255 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 
255 aa  245  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 
255 aa  245  5e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 
255 aa  244  9e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  55.33 
 
 
252 aa  244  1e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
264 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  51.39 
 
 
254 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 
253 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  50.99 
 
 
299 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  1.26458e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
253 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
257 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  46.12 
 
 
255 aa  239  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
261 aa  238  6e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 
249 aa  238  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 
257 aa  238  9e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
254 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 
254 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 
253 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 
256 aa  235  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 
253 aa  235  5e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.4 
 
 
255 aa  235  5e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
254 aa  234  1e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
249 aa  233  2e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 
253 aa  233  2e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 
255 aa  231  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 
254 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
253 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  44.62 
 
 
253 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  43.43 
 
 
253 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  43.43 
 
 
253 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  48 
 
 
255 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  50.61 
 
 
256 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  46.19 
 
 
253 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
273 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
250 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
250 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
250 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  49.21 
 
 
255 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  47.37 
 
 
250 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  46.64 
 
 
274 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
250 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  47.37 
 
 
250 aa  225  5e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
262 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 
252 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  48.63 
 
 
255 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  47.72 
 
 
242 aa  223  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  43.48 
 
 
252 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
255 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
260 aa  222  5e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 
251 aa  222  5e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  47.11 
 
 
250 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  51 
 
 
252 aa  221  1e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  47.76 
 
 
254 aa  220  1e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
257 aa  220  2e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  43.65 
 
 
252 aa  220  2e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 
250 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  42.69 
 
 
252 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
246 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  42.69 
 
 
252 aa  218  8e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  45.63 
 
 
256 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 
251 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  47.7 
 
 
259 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  43.25 
 
 
252 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
260 aa  216  3e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 
250 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  43.27 
 
 
251 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  46.44 
 
 
259 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>