157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0045 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  845    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.402941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0053  permease YjgP/YjgQ  94.23 
 
 		 428 aa  791    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0054  permease YjgP/YjgQ family protein  55.61 
 
 		 494 aa  485  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  30.77 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  29.69 
 
 		 360 aa  163  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  32.17 
 
 		 371 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  31.1 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  31.1 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  31.1 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  29.85 
 
 		 386 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  30.15 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  28.29 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  29.62 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  30.15 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  28.68 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  29.29 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.25 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  29.07 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  25.98 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  25.33 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.07 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 370 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  25.37 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 370 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  24.62 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  23.68 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  24.4 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  26.57 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  26.57 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 371 aa  97.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  23.84 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  22.51 
 
 		 359 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  25.45 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 370 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  21.74 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  24.87 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  24.93 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 364 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  25.67 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 364 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 363 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  25.4 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  25.45 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  23.65 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  23.71 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  25.45 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  25.45 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  25.45 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  25.45 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  25.45 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  25.19 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  25.06 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  25.06 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  25.06 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  25.06 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  25.06 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3719  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  23.95 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  23.65 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  23.3 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  23.36 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  23.36 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  23.36 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  23.36 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  23.36 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  23.36 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  24.6 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  20.21 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  23.64 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  23.08 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  22.76 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  22.47 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  22.19 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  22.19 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3556  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  22.83 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>