130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4486 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  100 
 
 		 128 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  94.53 
 
 		 128 aa  215  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  91.41 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  70.87 
 
 		 128 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19680  hypothetical protein  65.35 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1694  hypothetical protein  64.57 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  42.98 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  44.86 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  43.08 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  43.08 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  42.31 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  44.74 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  43.36 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  45.22 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  43.56 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  53.42 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  42.57 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  44.21 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  42.57 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  41.32 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  37.6 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  50.68 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  38.58 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  39.23 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  39.23 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  39.23 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  39.84 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  39.84 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  38.39 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  39.29 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  39.78 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  38.39 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  49.44 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  34.19 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  33.93 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  45.16 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  49.44 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  38.39 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  36.51 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  39.13 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  44.09 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  39.13 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  38.14 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  38.14 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  34.82 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  43.01 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  43.01 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  36.61 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  36.61 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  36.61 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  36.61 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  38.39 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  36.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  36.05 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  33.62 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  31.37 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  35.42 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0083  LrgA  48.31 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177337  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  31.53 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0273  hypothetical protein  43.06 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0268  hypothetical protein  41.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  33.61 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  29.46 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  36.9 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1576  LrgA family protein  30.43 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000178738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  24.79 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5236  holin-like protein  32.48 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  24.79 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  29.73 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  24.56 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5705  holin-like protein  31.62 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0190593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4925  holin-like protein  30.77 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.365696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5282  holin-like protein  31.62 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000144803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4960  holin-like protein  31.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4812  holin-like protein  31.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4822  holin-like protein  31.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5741  LrgA family protein  31.62 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5247  holin-like protein  31.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.697113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5218  holin-like protein  31.62 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  34.44 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  28 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2927  holin-like protein  35.04 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00321045  normal  0.271061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0020  LrgA family protein  25.89 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  32.32 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  27 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  28.95 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  27.59 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  33.04 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  24.79 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  33 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0253  murein hydrolase regulator LrgA  26.26 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>