More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3162 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  98.03 
 
 		 457 aa  910    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  99.34 
 
 		 457 aa  922    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  74.11 
 
 		 468 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  94.09 
 
 		 457 aa  885    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  72.87 
 
 		 464 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  74.05 
 
 		 467 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  73.21 
 
 		 461 aa  673    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  73.21 
 
 		 461 aa  673    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  100 
 
 		 457 aa  926    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  74.44 
 
 		 468 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  70.4 
 
 		 469 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  72.44 
 
 		 461 aa  670    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  73.3 
 
 		 461 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  68.31 
 
 		 459 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  65.32 
 
 		 477 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  63.53 
 
 		 477 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  68.18 
 
 		 463 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  62.22 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  65.34 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 444 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 		 452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  40 
 
 		 468 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 450 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  36.97 
 
 		 482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.14 
 
 		 447 aa  266  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  35.36 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  35.43 
 
 		 466 aa  253  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.28 
 
 		 447 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  34.36 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  34.36 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  34.36 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  33.8 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  34.12 
 
 		 433 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.63 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  33.89 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.11 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 440 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  34.87 
 
 		 461 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  34.87 
 
 		 461 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  34.87 
 
 		 461 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  33.63 
 
 		 484 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  32.82 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  36.85 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  37.92 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  32.17 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  40.87 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 628 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 452 aa  239  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.52 
 
 		 460 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  35.02 
 
 		 428 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  34.85 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  35.96 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  35.96 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  35.96 
 
 		 463 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 465 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  37.31 
 
 		 456 aa  236  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  33.63 
 
 		 455 aa  235  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  36.57 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  36.3 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.84 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  33.18 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1038  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  34.47 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  33.56 
 
 		 447 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.22 
 
 		 437 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  38.24 
 
 		 427 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.61 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0216  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.75 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  41.31 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  32.4 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  34.28 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4783  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 437 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  37.56 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.13 
 
 		 452 aa  230  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>