More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1904 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
411 aa  852  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  72.48 
 
 
410 aa  637  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  67.49 
 
 
409 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  68.87 
 
 
410 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  69.29 
 
 
407 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  66.91 
 
 
413 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  62.35 
 
 
409 aa  540  1e-152  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  61.61 
 
 
409 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  61.18 
 
 
408 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  59.37 
 
 
409 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  40.21 
 
 
395 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  38.76 
 
 
384 aa  276  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  40.93 
 
 
385 aa  275  2e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  40.48 
 
 
400 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  38.56 
 
 
425 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.2 
 
 
412 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  2.72693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.34 
 
 
397 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  38.18 
 
 
410 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  39.13 
 
 
389 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 
385 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.31 
 
 
399 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  36.85 
 
 
414 aa  254  2e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 
481 aa  254  2e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  39.58 
 
 
395 aa  252  9e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 
426 aa  252  9e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 
430 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 
419 aa  245  1e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.64 
 
 
419 aa  244  2e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  34.96 
 
 
419 aa  243  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.99976e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 
386 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  36.86 
 
 
408 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  38.36 
 
 
371 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 
422 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.25025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  36.66 
 
 
418 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.27 
 
 
415 aa  239  6e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  35.47 
 
 
417 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  36.66 
 
 
418 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 
420 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 
359 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 
418 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  34.51 
 
 
399 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.32 
 
 
399 aa  236  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.31963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  37.64 
 
 
364 aa  235  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 
402 aa  235  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
399 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  35.92 
 
 
417 aa  234  1e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  39.5 
 
 
365 aa  233  4e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.16 
 
 
393 aa  233  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  34.34 
 
 
412 aa  232  8e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  38.89 
 
 
378 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  34.09 
 
 
412 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  35.97 
 
 
448 aa  230  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 
410 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  34.09 
 
 
412 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 
380 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  37.57 
 
 
372 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  36.54 
 
 
414 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.71 
 
 
363 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  34.09 
 
 
412 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  34.87 
 
 
424 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  33.84 
 
 
412 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  33.84 
 
 
412 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  33.84 
 
 
412 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  33.84 
 
 
412 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.12 
 
 
354 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 
430 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  33.84 
 
 
412 aa  226  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  35.66 
 
 
431 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  38.16 
 
 
355 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  34.77 
 
 
411 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.38 
 
 
408 aa  223  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.99 
 
 
413 aa  223  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  34.73 
 
 
423 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  35.42 
 
 
409 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.31 
 
 
358 aa  222  1e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  38.61 
 
 
363 aa  221  2e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  34.72 
 
 
423 aa  221  2e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  35.4 
 
 
408 aa  221  2e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  38.31 
 
 
385 aa  221  2e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  36.74 
 
 
367 aa  221  2e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 
406 aa  221  2e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 
409 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  34.52 
 
 
421 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  35.14 
 
 
417 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  35.14 
 
 
449 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 
413 aa  219  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  37.12 
 
 
392 aa  219  8e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.46 
 
 
407 aa  219  9e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 
357 aa  219  9e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  35.83 
 
 
385 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  34.79 
 
 
417 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  34.46 
 
 
431 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  38.48 
 
 
378 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  37.89 
 
 
356 aa  217  3e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  38.98 
 
 
364 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 
415 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  37.36 
 
 
364 aa  216  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  37.71 
 
 
378 aa  216  6e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>