More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1176 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  100 
 
 
243 aa  487  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  58.58 
 
 
243 aa  284  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  60.83 
 
 
264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  60 
 
 
239 aa  260  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  60 
 
 
239 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  59.32 
 
 
240 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  58.82 
 
 
241 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  45.1 
 
 
263 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  46.41 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  46.57 
 
 
241 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  39.75 
 
 
242 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  36.24 
 
 
211 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  41.58 
 
 
242 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  39.75 
 
 
243 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  40.59 
 
 
242 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  43.6 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  40.19 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  40.1 
 
 
242 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  41.09 
 
 
242 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  40.59 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  40.59 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  35.64 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  35.24 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  40.1 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  40.1 
 
 
242 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  40.1 
 
 
242 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  40.1 
 
 
242 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.97 
 
 
244 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 
228 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  33.66 
 
 
228 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  28.57 
 
 
228 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  45.71 
 
 
251 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  35.29 
 
 
225 aa  122  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  45.71 
 
 
262 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  37.73 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  39.52 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  38.42 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  30.17 
 
 
243 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  32.83 
 
 
190 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  32.97 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  41.35 
 
 
234 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  36.82 
 
 
245 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  36.71 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  32.47 
 
 
186 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  40.57 
 
 
226 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  36.15 
 
 
226 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  40.45 
 
 
223 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  38.73 
 
 
248 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  32.71 
 
 
225 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  35.78 
 
 
228 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  37.39 
 
 
474 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  36.23 
 
 
239 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  34.55 
 
 
247 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  31.92 
 
 
226 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  36.41 
 
 
237 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  33.18 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  33.18 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 
225 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  38.05 
 
 
240 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
231 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  32.42 
 
 
213 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 
225 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  31.05 
 
 
238 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0261  dethiobiotin synthase  37.07 
 
 
219 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.909674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 
225 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  37.11 
 
 
229 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  36.11 
 
 
227 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  33 
 
 
225 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
231 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  33.18 
 
 
225 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  37.13 
 
 
204 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  36.24 
 
 
226 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  43.69 
 
 
227 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  34.3 
 
 
227 aa  103  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 
238 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  32.71 
 
 
225 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  37.84 
 
 
237 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  34.47 
 
 
221 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  34.96 
 
 
234 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  32.71 
 
 
225 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 
224 aa  101  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  34.96 
 
 
226 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.6 
 
 
646 aa  101  9e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  32.96 
 
 
225 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  34.82 
 
 
220 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  31.52 
 
 
239 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  35.78 
 
 
234 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  30.97 
 
 
228 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  35.78 
 
 
234 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  36.71 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  33.33 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  31.96 
 
 
210 aa  99.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  39.05 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  31.55 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  31.55 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  32.03 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>