More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0190 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
410 aa  852  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  68.87 
 
 
411 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  67.64 
 
 
410 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  68.8 
 
 
407 aa  582  1e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  65.28 
 
 
408 aa  562  1e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  65.6 
 
 
409 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  67.57 
 
 
413 aa  554  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  63.05 
 
 
409 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  62.81 
 
 
409 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  58.97 
 
 
409 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  41.56 
 
 
395 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  41.87 
 
 
400 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  39.22 
 
 
384 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 
412 aa  273  5e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  2.72693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  36.55 
 
 
425 aa  270  3e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  38.52 
 
 
410 aa  270  3e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.18 
 
 
399 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  36.5 
 
 
386 aa  267  3e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 
385 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  35.68 
 
 
414 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 
418 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  37.37 
 
 
419 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  36.48 
 
 
397 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  38.38 
 
 
395 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  36.52 
 
 
418 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  38.08 
 
 
385 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.11 
 
 
419 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  36.76 
 
 
399 aa  255  1e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  37.02 
 
 
389 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  36.27 
 
 
418 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  38.04 
 
 
481 aa  252  9e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 
408 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  39.5 
 
 
414 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 
417 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.02 
 
 
415 aa  245  1e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  37.56 
 
 
420 aa  245  1e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.99 
 
 
399 aa  244  2e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.31963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  35.96 
 
 
414 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 
426 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  34.53 
 
 
393 aa  240  3e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  36.79 
 
 
430 aa  240  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  36.1 
 
 
408 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  34.45 
 
 
399 aa  239  6e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  36.01 
 
 
408 aa  239  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  36.9 
 
 
422 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.25025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
424 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.37 
 
 
380 aa  235  1e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  35.64 
 
 
402 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  35.03 
 
 
412 aa  233  4e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  34.43 
 
 
412 aa  233  4e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  34.52 
 
 
412 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 
410 aa  233  7e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  33.66 
 
 
419 aa  232  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.99976e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  35.84 
 
 
390 aa  230  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 
359 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  35.32 
 
 
390 aa  229  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  33.92 
 
 
412 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  36.52 
 
 
364 aa  227  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 
406 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  35.58 
 
 
391 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  34.18 
 
 
412 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 
357 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 
415 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  38.66 
 
 
378 aa  226  5e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  34.41 
 
 
430 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  33.92 
 
 
412 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  36.15 
 
 
371 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  35.08 
 
 
423 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  37.28 
 
 
378 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  3.1101e-06 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  36.52 
 
 
367 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  37.28 
 
 
378 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.79 
 
 
414 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  33.08 
 
 
413 aa  223  7e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
385 aa  222  1e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  38.12 
 
 
381 aa  222  1e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.79 
 
 
378 aa  221  2e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  36.34 
 
 
356 aa  221  2e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  38.55 
 
 
356 aa  221  2e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  38.55 
 
 
356 aa  221  2e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  36.49 
 
 
374 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  31.99 
 
 
431 aa  219  8e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  35.88 
 
 
360 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  34.46 
 
 
409 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  36.39 
 
 
365 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 
369 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.22148e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  36.29 
 
 
354 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  37.5 
 
 
355 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 
409 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  35.85 
 
 
359 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  32.92 
 
 
425 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  37.08 
 
 
364 aa  217  3e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  34.17 
 
 
421 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  37.32 
 
 
385 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  34.54 
 
 
431 aa  216  6e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  37.06 
 
 
368 aa  215  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>