More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0001 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
450 aa  932    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  65.63 
 
 
459 aa  617  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  56.95 
 
 
449 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  56.26 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  54.53 
 
 
458 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  55.33 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  53.85 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  53.71 
 
 
452 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.31 
 
 
461 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.22 
 
 
453 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  46.31 
 
 
457 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.38 
 
 
454 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  48.21 
 
 
440 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
450 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  46.31 
 
 
457 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.27 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  46.39 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  46.26 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  46.26 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  46.26 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.39 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  46.26 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  46.26 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  46.27 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  47.22 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  47.76 
 
 
442 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  45.81 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  46.76 
 
 
446 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  46.38 
 
 
443 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.87 
 
 
444 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.07 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  43.88 
 
 
441 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  45.83 
 
 
443 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.02 
 
 
439 aa  385  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.51 
 
 
463 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.25 
 
 
439 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.79 
 
 
449 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.28 
 
 
498 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.86 
 
 
446 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.96 
 
 
447 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  44.7 
 
 
445 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  43.27 
 
 
451 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 
453 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 
453 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  41.27 
 
 
478 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  43.64 
 
 
436 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.27 
 
 
455 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.43 
 
 
458 aa  366  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.83 
 
 
470 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  42.04 
 
 
448 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 
452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 
452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  40.54 
 
 
461 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
449 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.69 
 
 
453 aa  358  9e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.14 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  41.26 
 
 
452 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.26 
 
 
503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  40.18 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
467 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.59 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  39.59 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  39.46 
 
 
472 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
466 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
466 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.72 
 
 
447 aa  355  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
466 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
466 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
466 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  39.59 
 
 
467 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.41 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  41.44 
 
 
465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  40.32 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.89 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  39.37 
 
 
467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  40.32 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 
482 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  39.19 
 
 
481 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 
465 aa  353  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  42.29 
 
 
452 aa  352  7e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 
462 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.88 
 
 
519 aa  352  8.999999999999999e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  39.56 
 
 
465 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.03 
 
 
455 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.76 
 
 
495 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  39.74 
 
 
478 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.64 
 
 
461 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.77 
 
 
483 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 
495 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 
495 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 
495 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  40.22 
 
 
460 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
470 aa  350  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>