More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2546 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  84.84 
 
 		 244 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  84.43 
 
 		 244 aa  431  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  84.02 
 
 		 244 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  84.84 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  84.02 
 
 		 244 aa  417  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  81.15 
 
 		 244 aa  417  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  66.25 
 
 		 249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  65.84 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  64.44 
 
 		 243 aa  323  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  64.44 
 
 		 243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  64.85 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  64.71 
 
 		 243 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 		 246 aa  314  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  61.51 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 		 251 aa  301  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  60.67 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  58.51 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  59.83 
 
 		 310 aa  298  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  61.8 
 
 		 277 aa  298  4e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 		 249 aa  298  5e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 336 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  59.24 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  59 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  60.83 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  59.66 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 		 332 aa  292  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  57.08 
 
 		 321 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  59.07 
 
 		 316 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  58.65 
 
 		 333 aa  291  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.17 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  59.07 
 
 		 314 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  56.73 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  57.92 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  55.27 
 
 		 258 aa  289  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.75 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  56.02 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  58.65 
 
 		 317 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.83 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  56.72 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 254 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  58.23 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 258 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 277 aa  287  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.84 
 
 		 255 aa  287  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  56.43 
 
 		 279 aa  286  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  58.82 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  59.18 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  57.08 
 
 		 311 aa  286  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  59.18 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  58.65 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  56.12 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  59.92 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  59.18 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  57.5 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  56.49 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  59.18 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  57.5 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  59.18 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  60.25 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  56.54 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  57.38 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.92 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  58.85 
 
 		 255 aa  284  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  58.78 
 
 		 261 aa  284  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  58.09 
 
 		 241 aa  284  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  58.09 
 
 		 241 aa  284  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  56.36 
 
 		 256 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.08 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.83 
 
 		 268 aa  284  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  59.83 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  59.83 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  59.83 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  58.78 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.78 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  56.96 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  57.38 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  59.49 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.67 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.38 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  58.78 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>