More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2352 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  100 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  76.39 
 
 		 288 aa  454  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  72.57 
 
 		 288 aa  427  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  72.57 
 
 		 288 aa  424  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  73.96 
 
 		 288 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  66.9 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  64.11 
 
 		 288 aa  367  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  46.32 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  45.45 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.96 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  42.71 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  42.71 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  42.66 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  42.31 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.49 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.83 
 
 		 311 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  39.16 
 
 		 275 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  43.51 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  42.32 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  40.91 
 
 		 267 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.46 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.73 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  41.05 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  36.79 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  41.05 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  41.05 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  37.33 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  39.08 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  38.23 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  40.27 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  38.78 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  37.07 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.55 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  42.76 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  40.34 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  40.96 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43.9 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  37.68 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  40.45 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  36.39 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  38.98 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  39.12 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  40.91 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0649  translation elongation factor Ts  40.77 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.301511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  38.67 
 
 		 314 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  36.84 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  38.23 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  41.4 
 
 		 290 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  37.98 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  39.15 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.65 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  38.25 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  37.54 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  38.54 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  39.69 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  38.1 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  38.25 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  38.98 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  38.6 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  38.31 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  39.24 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  38.78 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  36.64 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  39.45 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  37.89 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  36.49 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  37.2 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  38.21 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  36.39 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  37.88 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  37.04 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  39.04 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  41.4 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  36.61 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  36.77 
 
 		 307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  36.3 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.61 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  36.3 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  38.23 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  39.18 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.26 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  34.77 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.26 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  38.19 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  38.54 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  38.54 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  38.54 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  37.76 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  38.23 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  37.25 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>