More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1631 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 360 aa  739    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  68.07 
 
 		 363 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  65.46 
 
 		 360 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  62.64 
 
 		 363 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  60.96 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  54.78 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  53.65 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  46.15 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  45.41 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  42.13 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  41.64 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  42.08 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  44.08 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  42.02 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  42.97 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  44.51 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  43.53 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  41.53 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  43.92 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  43.84 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  43.84 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  43.84 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  43.84 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  43.84 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  43.84 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  43.84 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  42.7 
 
 		 351 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  41.94 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  43.14 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  41.94 
 
 		 361 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  42.7 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  42.54 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  42.54 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  41.94 
 
 		 361 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  43.14 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  41.67 
 
 		 362 aa  288  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  41.67 
 
 		 361 aa  288  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  42.27 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  43.01 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  42.39 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  43.8 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  43.09 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  41.05 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  41.05 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  43.37 
 
 		 367 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  40.77 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 343 aa  278  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  42.86 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  43.3 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  41.8 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  42.5 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  40.95 
 
 		 350 aa  272  6e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  41.53 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  42.06 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  39.72 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  42.51 
 
 		 373 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  38.94 
 
 		 356 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  38.94 
 
 		 356 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  41.55 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  39 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  39.95 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  41.24 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  42.86 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 		 347 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  40.27 
 
 		 353 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  41.21 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  41.94 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  39.66 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  41.35 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  42.61 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  38.15 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  42.37 
 
 		 322 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  39.17 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 373 aa  248  9e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  38.36 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  38.36 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  38.36 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  40.11 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  41.64 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  40.61 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  39.35 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  38.4 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  38.25 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  39.41 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  39.72 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  37.85 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  38.16 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  40.21 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  37.92 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>