More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1473 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 142 aa  298  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  76.76 
 
 		 142 aa  237  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  74.65 
 
 		 142 aa  231  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  74.47 
 
 		 142 aa  227  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  67.38 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  68.38 
 
 		 144 aa  201  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  55.56 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.76 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  52.52 
 
 		 164 aa  133  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.2 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  52.63 
 
 		 139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.92 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  51.56 
 
 		 138 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  52.99 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  54.4 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  50.77 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  50.76 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.36 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  48.92 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  44.93 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.1 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  49.23 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  49.62 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.38 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  52.24 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  47.59 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.32 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  49.64 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.82 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  51.24 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  48.44 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.8 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  45.67 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  51.15 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.29 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  42.55 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  46.72 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  50.38 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  49.61 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  49.24 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 258 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 140 aa  106  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  44.27 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  43.57 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.28 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.73 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  43.38 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 254 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  41.79 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  41.79 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  40.29 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.48 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  41.79 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  44.03 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  42.54 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  46.09 
 
 		 258 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  41.79 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  41.26 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1932  protein tyrosine phosphatase  40.14 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  36.57 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  41.79 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  39.55 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.71 
 
 		 299 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2184  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.23 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000653418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  39.71 
 
 		 299 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.6 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  39.71 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  35.97 
 
 		 132 aa  91.7  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 284 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.56 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4708  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.15 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  43.08 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2663  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.69 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.541261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 276 aa  88.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.88 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.42 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>