More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1104 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 506 aa  1058    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  66.36 
 
 		 325 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  65 
 
 		 336 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  65 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  63.44 
 
 		 325 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  65.76 
 
 		 295 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  61.56 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  59.32 
 
 		 327 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  57.81 
 
 		 320 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  56.88 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  57.68 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  57.37 
 
 		 319 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  56.43 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  54.18 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  56.11 
 
 		 321 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  57.19 
 
 		 333 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  55.8 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  56.74 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  56.74 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  56.43 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  56.43 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  56.29 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  56.43 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  54.86 
 
 		 321 aa  360  5e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  54.23 
 
 		 321 aa  356  5e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  51.08 
 
 		 325 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  53.12 
 
 		 316 aa  325  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  56.43 
 
 		 288 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  44.62 
 
 		 338 aa  280  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  43.08 
 
 		 340 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  42.81 
 
 		 335 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 177 aa  257  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  65.36 
 
 		 180 aa  257  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  51.68 
 
 		 335 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  73.29 
 
 		 150 aa  249  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  65.64 
 
 		 190 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  42.72 
 
 		 323 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  71.52 
 
 		 160 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  47.93 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  56.82 
 
 		 171 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  53.71 
 
 		 184 aa  209  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  40 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  61.64 
 
 		 171 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  40.31 
 
 		 326 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  63.12 
 
 		 154 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  57.23 
 
 		 176 aa  196  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  46.49 
 
 		 189 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 		 180 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  53.68 
 
 		 137 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 		 137 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  54.76 
 
 		 138 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 		 132 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  68.57 
 
 		 112 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  53.12 
 
 		 130 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 		 159 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 		 133 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.97 
 
 		 135 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.14 
 
 		 131 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 163 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  51.59 
 
 		 134 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  49.24 
 
 		 140 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 140 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 142 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  51.97 
 
 		 135 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  48.06 
 
 		 151 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 141 aa  143  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  49.61 
 
 		 136 aa  143  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 		 142 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 137 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  47.73 
 
 		 139 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  47.33 
 
 		 147 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 185 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  44.3 
 
 		 183 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  47.58 
 
 		 130 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  32 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 134 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 161 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  29.45 
 
 		 316 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 		 135 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 		 140 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  48 
 
 		 133 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  52.85 
 
 		 156 aa  140  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 148 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  49.19 
 
 		 144 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  48.89 
 
 		 137 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  31.91 
 
 		 314 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 134 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  49.6 
 
 		 136 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 146 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 		 159 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  48.87 
 
 		 137 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  46.27 
 
 		 140 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 		 137 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  48.87 
 
 		 136 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  50.83 
 
 		 133 aa  138  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 141 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  49.18 
 
 		 142 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 		 131 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 137 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 		 132 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>