43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0922 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
176 aa  348  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  87.5 
 
 
336 aa  311  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  71.68 
 
 
323 aa  246  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  69.36 
 
 
325 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  64.74 
 
 
321 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  72.3 
 
 
295 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  56.65 
 
 
325 aa  200  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  57.23 
 
 
506 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  53.8 
 
 
327 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  53.25 
 
 
320 aa  174  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  51.45 
 
 
333 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  50.57 
 
 
288 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  44 
 
 
321 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  43.27 
 
 
321 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  43.86 
 
 
321 aa  141  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  42.69 
 
 
321 aa  141  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  45.03 
 
 
324 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  40.94 
 
 
321 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  42.53 
 
 
324 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  42.69 
 
 
321 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  42.11 
 
 
321 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  42.11 
 
 
321 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  42.11 
 
 
321 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  41.52 
 
 
321 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  41.52 
 
 
321 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  43.03 
 
 
327 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  41.18 
 
 
325 aa  127  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  39.18 
 
 
319 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  39.64 
 
 
338 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  37.36 
 
 
340 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  38.73 
 
 
316 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  37.28 
 
 
335 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  30.41 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  33.77 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1349  protein of unknown function DUF1568  47.76 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.655489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  32.74 
 
 
326 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  32.93 
 
 
334 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  31.03 
 
 
323 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1332  protein of unknown function DUF1568  42.62 
 
 
61 aa  47.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  28.18 
 
 
318 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  26.09 
 
 
316 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  30.83 
 
 
319 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>