25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1349 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1349  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 
82 aa  163  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.655489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  77.46 
 
 
320 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  53.62 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  49.25 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  47.76 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  44.62 
 
 
321 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  46.15 
 
 
325 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  40.3 
 
 
288 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  45.16 
 
 
327 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  45.16 
 
 
323 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  45.16 
 
 
325 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  35.38 
 
 
506 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  41.27 
 
 
321 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  38.33 
 
 
316 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  36.51 
 
 
321 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  38.33 
 
 
321 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  38.33 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  35.48 
 
 
325 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  43.1 
 
 
319 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  40 
 
 
324 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>