287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1359 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  81.61 
 
 		 175 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  52.53 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  52.14 
 
 		 287 aa  285  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  47.74 
 
 		 284 aa  281  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  46.53 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  52.53 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  49.25 
 
 		 287 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  51.75 
 
 		 287 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  51.36 
 
 		 289 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  49.62 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  49.25 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  49.61 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  46.84 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.79 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  46.72 
 
 		 288 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  46.74 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  47.91 
 
 		 291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  46.33 
 
 		 288 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  45.38 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  45.38 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  43.73 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  48.41 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  44.78 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  45.93 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  44.78 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  48.09 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.04 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  46.85 
 
 		 299 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  49.05 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  44.19 
 
 		 268 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  44.11 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  46.27 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  46.27 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  45.52 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  46.27 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  48.45 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  45.9 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  45.9 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  45.9 
 
 		 319 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  48.36 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  41.4 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  44.66 
 
 		 288 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  47.92 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  42.91 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  43.13 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  41.88 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  44.23 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  40.23 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  45.59 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  39.73 
 
 		 291 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  44.49 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  44.19 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  42.53 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  43.63 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  42.86 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  41.67 
 
 		 271 aa  202  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  40.86 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  39.76 
 
 		 282 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  40.31 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  37.65 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  50.75 
 
 		 147 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  51.41 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  47.62 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  40.87 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  35.04 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  38.8 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  47.92 
 
 		 267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.93 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  49.3 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  45.7 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  40.86 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  44.59 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  49.3 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  42.17 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  38.25 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  38.32 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  34.48 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  47.22 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  33.72 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.45 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  35.61 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  44.16 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  49.3 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  45.52 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  40.57 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  44.44 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  46.81 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  45.83 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  55.36 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  44.37 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  35.78 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  35.78 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  32.63 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  44.9 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  38.39 
 
 		 245 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  39.18 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  47.68 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>