228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0590 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  366  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  81.61 
 
 		 285 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  54.34 
 
 		 291 aa  208  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  53.76 
 
 		 287 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  53.76 
 
 		 287 aa  208  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  54.34 
 
 		 301 aa  207  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  53.76 
 
 		 284 aa  207  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  56.8 
 
 		 288 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  56.4 
 
 		 292 aa  204  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  54.82 
 
 		 297 aa  204  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  55.69 
 
 		 342 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  53.76 
 
 		 287 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  54.91 
 
 		 318 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  52.57 
 
 		 287 aa  201  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  52.3 
 
 		 297 aa  200  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  54.22 
 
 		 270 aa  200  8e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  52.6 
 
 		 302 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  52.6 
 
 		 342 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  56.63 
 
 		 282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  56.63 
 
 		 282 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  54.34 
 
 		 299 aa  198  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  54.34 
 
 		 315 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  54.34 
 
 		 292 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  54.34 
 
 		 292 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  52 
 
 		 287 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  53.76 
 
 		 319 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  53.76 
 
 		 319 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  53.76 
 
 		 319 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  52.6 
 
 		 301 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  52.6 
 
 		 289 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  51.81 
 
 		 292 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  52.02 
 
 		 275 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  50.29 
 
 		 299 aa  191  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  51.15 
 
 		 303 aa  191  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  51.46 
 
 		 288 aa  191  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  52.73 
 
 		 274 aa  190  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  52.66 
 
 		 296 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  51.81 
 
 		 294 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  53.33 
 
 		 268 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  52.73 
 
 		 268 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  49.7 
 
 		 304 aa  187  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  52.41 
 
 		 288 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  52.41 
 
 		 291 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  52.41 
 
 		 288 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  50.9 
 
 		 279 aa  185  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  50.9 
 
 		 279 aa  185  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  50.9 
 
 		 276 aa  185  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  49.71 
 
 		 288 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  50.89 
 
 		 276 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  50.6 
 
 		 273 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  52.02 
 
 		 305 aa  180  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  50.91 
 
 		 284 aa  177  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  46.99 
 
 		 272 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  48.28 
 
 		 271 aa  174  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  50.6 
 
 		 285 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  170  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  46.75 
 
 		 261 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  49.7 
 
 		 279 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  48.75 
 
 		 251 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  50.3 
 
 		 283 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  47.31 
 
 		 318 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  55.2 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  52.85 
 
 		 282 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  49.4 
 
 		 225 aa  144  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  46.11 
 
 		 245 aa  140  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  42.86 
 
 		 266 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  43.45 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  40.12 
 
 		 244 aa  131  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  44.38 
 
 		 273 aa  130  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  47.83 
 
 		 259 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  47.1 
 
 		 248 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  47.18 
 
 		 240 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  42.07 
 
 		 313 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  44.08 
 
 		 220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  46.38 
 
 		 267 aa  127  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  42.86 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  41.32 
 
 		 262 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  37.57 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  49.6 
 
 		 266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  40.48 
 
 		 261 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  44.16 
 
 		 229 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  45.75 
 
 		 241 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  45.65 
 
 		 267 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  42.76 
 
 		 263 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  47.1 
 
 		 280 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  41.46 
 
 		 260 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  51.82 
 
 		 266 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  39.51 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  41.42 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  44.74 
 
 		 263 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  39.74 
 
 		 252 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  39.74 
 
 		 252 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  39.74 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  37.87 
 
 		 259 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  46.38 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  35.91 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  39.74 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  39.74 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  41.04 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  41.61 
 
 		 244 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>