More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0076 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  80.75 
 
 		 428 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0069  uracil-xanthine permease  81.07 
 
 		 428 aa  676    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0117  uracil-xanthine permease  85.75 
 
 		 428 aa  729    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0102  uracil-xanthine permease  80.38 
 
 		 433 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.836005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  83.18 
 
 		 435 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0068  uracil-xanthine permease  82.48 
 
 		 428 aa  673    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0048  uracil-xanthine permease  82.71 
 
 		 428 aa  673    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736072  normal  0.463127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0076  uracil-xanthine permease  100 
 
 		 428 aa  832    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  75.37 
 
 		 553 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0291  uracil-xanthine permease  73.47 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.318385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0279  uracil-xanthine permease  75.61 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3337  xanthine/uracil permease family protein  75.61 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3342  uracil-xanthine permease  75.61 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.375852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2087  uracil-xanthine permease  75.61 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.950679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3006  uracil-xanthine permease  75.61 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0476  uracil permease  73.24 
 
 		 435 aa  594  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3008  uracil-xanthine permease  72.64 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0138  uracil-xanthine permease  71.09 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3058  uracil-xanthine permease  72.34 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.507498  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3032  uracil-xanthine permease  73.17 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2399  uracil-xanthine permease  73.17 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3013  uracil-xanthine permease  73.17 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00614211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0413  uracil-xanthine permease  72.04 
 
 		 435 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4294  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  71.8 
 
 		 435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000625543  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01009  predicted transporter  67.84 
 
 		 442 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2589  uracil-xanthine permease  67.84 
 
 		 442 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.11462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6359  xanthine/uracil tranporter  70.69 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2923  uracil-xanthine permease  72.1 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1124  putative purine permease ycdG  68.08 
 
 		 442 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01016  hypothetical protein  67.84 
 
 		 442 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2636  uracil-xanthine permease  67.84 
 
 		 442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.880148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1243  putative purine permease ycdG  67.37 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2119  putative purine permease ycdG  67.37 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1818  uracil-xanthine permease  67.69 
 
 		 439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0927145  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1121  putative purine permease ycdG  67.84 
 
 		 442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1519  uracil-xanthine permease  66.67 
 
 		 442 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2561  xanthine/uracil permease  66.1 
 
 		 432 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0730  uracil-xanthine permease  65.54 
 
 		 482 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3801  uracil-xanthine permease  62.17 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0564  uracil-xanthine permease  59.51 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.880144  hitchhiker  0.00366234 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1196  uracil-xanthine permease  61.37 
 
 		 477 aa  478  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.179657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1195  xanthine/uracil symporter  61.37 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5089  uracil-xanthine permease  60.72 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4693  uracil-xanthine permease  58.33 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.210372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2859  uracil-xanthine permease  57.91 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0442  uracil-xanthine permease  54.99 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0384  uracil-xanthine permease  54.99 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0717  uracil-xanthine permease  46.08 
 
 		 414 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0188  uracil-xanthine permease  47.41 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0172  uracil-xanthine permease  46.39 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1374  uracil-xanthine permease  47.65 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0546  uracil-xanthine permease  47.16 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923027  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0556  uracil-xanthine permease  47.16 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0568  uracil-xanthine permease  47.16 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  hitchhiker  0.00756826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2231  uracil-xanthine permease  45.41 
 
 		 455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0398  uracil-xanthine permease  44.52 
 
 		 469 aa  322  8e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.406463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18180  uracil-xanthine permease  50 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0265  uracil-xanthine permease  46.54 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0461  uracil-xanthine permease  47.93 
 
 		 425 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0128  uracil-xanthine permease  47.07 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06620  uracil-xanthine permease  43.19 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1518  xanthine/uracil permease  45.15 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2968  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.89 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0233  uracil-xanthine permease  42.43 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0222  uracil-xanthine permease  43.09 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0652  uracil-xanthine permease  44.58 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1488  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 		 487 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  46.47 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3150  uracil-xanthine permease  46.71 
 
 		 454 aa  299  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0274  uracil-xanthine permease  45.1 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.0000340843  hitchhiker  0.000019379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6670  putative purine permease  43.76 
 
 		 473 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20890  xanthine/uracil permease  42.66 
 
 		 457 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.433718  normal  0.0375498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04620  uracil-xanthine permease  46.06 
 
 		 436 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.228436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  40.82 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  40.82 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1870  uracil-xanthine permease  42.23 
 
 		 487 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  40.58 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5794  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.51 
 
 		 415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0650  Xanthine/uracil permease  43.18 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.302997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  40.54 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  40.54 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  40.54 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  38.55 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  41.11 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  40.9 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  38.55 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  41.11 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  41.11 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  41.11 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  41.11 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  41.11 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  37.84 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  40.9 
 
 		 427 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  39.27 
 
 		 422 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  38.88 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  39.61 
 
 		 429 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  38.74 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  38.74 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  40.95 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  40.95 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>