220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0113 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
359 aa  721    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  48.43 
 
 
328 aa  291  9e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  48.29 
 
 
329 aa  288  7e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  48.11 
 
 
328 aa  288  8e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  45.6 
 
 
329 aa  272  8.000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  39.08 
 
 
333 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  41.56 
 
 
332 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  42.5 
 
 
334 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  36.68 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  38.01 
 
 
323 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  37.69 
 
 
343 aa  226  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  38.66 
 
 
328 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  35.28 
 
 
344 aa  223  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  38.12 
 
 
335 aa  224  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  37.19 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  35.11 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  35 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  39.08 
 
 
334 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  37.38 
 
 
331 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  35.8 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  38.63 
 
 
327 aa  212  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  33.94 
 
 
334 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  36.25 
 
 
352 aa  207  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  34.48 
 
 
359 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  32.75 
 
 
363 aa  206  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  34.48 
 
 
359 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  34.48 
 
 
359 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  35.19 
 
 
363 aa  205  8e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  35.26 
 
 
330 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  35.19 
 
 
332 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  31.46 
 
 
375 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  34.89 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  33.05 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  30.72 
 
 
331 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  30.96 
 
 
372 aa  189  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  33.74 
 
 
348 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  32.3 
 
 
353 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.17 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  27.49 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  27.68 
 
 
314 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 
326 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 
325 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  27.02 
 
 
335 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  27.02 
 
 
335 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  30.04 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  28.93 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  28.93 
 
 
326 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  26.46 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  26.32 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  27.44 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  25.79 
 
 
333 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  27.22 
 
 
326 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  30.58 
 
 
320 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  27.24 
 
 
351 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
308 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  25.37 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  25.7 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  25.31 
 
 
329 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31090  flagellar motor switch protein  26.96 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  0.579605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  28.87 
 
 
314 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0746  flagellar motor switch protein FliM  28.03 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
347 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 
332 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  26.71 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  26.71 
 
 
337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  26.23 
 
 
328 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
329 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  26.02 
 
 
334 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  26.02 
 
 
334 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  23.08 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 
332 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  25.22 
 
 
338 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
343 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3568  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
332 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  23.2 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  25.94 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  25.39 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  24.39 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>