More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1566 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  100 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  54.32 
 
 		 187 aa  164  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  48.54 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  48.24 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  52.05 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  50.34 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  52.82 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  51.03 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  41.83 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  44.06 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  39.47 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.96 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  44.14 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  39.1 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  43.71 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  39.73 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.33 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  43.27 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  39.33 
 
 		 157 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  38.46 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  39.6 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  43.71 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  41.78 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  40.14 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.62 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  39.29 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  43.36 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  38.31 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.26 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  39.6 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  41.55 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  39.6 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  41.55 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  39.69 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  41.55 
 
 		 194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.71 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  38.06 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  39.69 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  38.78 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  39.69 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  38.13 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  37.33 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  35.29 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  38.31 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  38.31 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  35.86 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  38.41 
 
 		 194 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  35.81 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  33.33 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  34.19 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  39.13 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  33.56 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  39.07 
 
 		 205 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  34.38 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.14 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  31.85 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  35.37 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  30.99 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.21 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.57 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  33.8 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  34.01 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.91 
 
 		 159 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.91 
 
 		 159 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.91 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.91 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.91 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  39.52 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.91 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.72 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  36.23 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  39.13 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  36.17 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.11 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  36.76 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  32.87 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.9 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.73 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  31.82 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  35.06 
 
 		 159 aa  94  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  31.08 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.43 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.86 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.4 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.11 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.78 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.11 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  31.68 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  34.62 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  32.69 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  36.03 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.44 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.17 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  33.55 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.03 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>