More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1397 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  100 
 
 
176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  96.02 
 
 
198 aa  341  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  81.82 
 
 
197 aa  300  9e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  80.68 
 
 
196 aa  273  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  59.18 
 
 
209 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  53.7 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  56.88 
 
 
191 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  56.88 
 
 
191 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  60.14 
 
 
309 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  61.27 
 
 
307 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  61.27 
 
 
307 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  52.38 
 
 
204 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  52.38 
 
 
204 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  53.79 
 
 
194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  53.79 
 
 
194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  49.42 
 
 
219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  50.57 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  52.26 
 
 
191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  52.15 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  54.05 
 
 
199 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  52.53 
 
 
204 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  52.53 
 
 
204 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  52.53 
 
 
204 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  54.32 
 
 
197 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  55.63 
 
 
201 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  55.41 
 
 
197 aa  158  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  55.78 
 
 
184 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  49.7 
 
 
205 aa  158  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  53.29 
 
 
201 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  52.2 
 
 
210 aa  157  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  53.75 
 
 
193 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  51.27 
 
 
204 aa  157  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  52.87 
 
 
182 aa  157  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  53.95 
 
 
188 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  54.42 
 
 
184 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  55.41 
 
 
201 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  56.25 
 
 
184 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  50 
 
 
188 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  59.15 
 
 
198 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  49.71 
 
 
185 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  53.8 
 
 
193 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  55.17 
 
 
188 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  50.57 
 
 
188 aa  154  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50.31 
 
 
187 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  51.48 
 
 
215 aa  154  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  54.9 
 
 
188 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  49.35 
 
 
196 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  49.43 
 
 
185 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 
185 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  52.53 
 
 
206 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  48.57 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  53.47 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  53.47 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  53.47 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  46.95 
 
 
201 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  54.27 
 
 
190 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  50.3 
 
 
194 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  46.95 
 
 
181 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  47.43 
 
 
185 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  59.09 
 
 
201 aa  147  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  50.61 
 
 
184 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  50.61 
 
 
184 aa  147  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  46.95 
 
 
183 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  46.95 
 
 
183 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  56.69 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  48.57 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  48.57 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  56.69 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  56.69 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  56.69 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  54.55 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  52.74 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  43.53 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  49.31 
 
 
192 aa  143  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  49.09 
 
 
228 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  49.31 
 
 
197 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  49.31 
 
 
197 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  52.86 
 
 
191 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  52.03 
 
 
305 aa  141  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  48.72 
 
 
183 aa  141  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  47.2 
 
 
189 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  45.12 
 
 
194 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  48.98 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  49.06 
 
 
293 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  46.95 
 
 
194 aa  138  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  45.57 
 
 
188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  45.57 
 
 
187 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  45.57 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  48.82 
 
 
209 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  46.88 
 
 
206 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  43.64 
 
 
199 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  54.76 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  47.24 
 
 
324 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  53.08 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  47.5 
 
 
214 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  52.82 
 
 
203 aa  134  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  48.57 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  45.27 
 
 
188 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.07 
 
 
201 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>