228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0049 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0049  porphyrin biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 155 aa  317  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.843521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  52.78 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  51.05 
 
 		 153 aa  166  9e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  48.61 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1844  siroheme synthase  47.92 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0042  porphyrin biosynthesis protein, putative  45.45 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  46.15 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  30.56 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  32.14 
 
 		 218 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  29.05 
 
 		 213 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  30.77 
 
 		 224 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 411 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  29.37 
 
 		 312 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  25.52 
 
 		 626 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  31.01 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  33.86 
 
 		 407 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  30.82 
 
 		 235 aa  77.4  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1775  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.13 
 
 		 473 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0534697  normal  0.7368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  37.01 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  28.19 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2526  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  30.08 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  29.86 
 
 		 306 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  30.07 
 
 		 306 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  28.12 
 
 		 195 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.61 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.09 
 
 		 554 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  27.48 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  28.95 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  32.65 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  30 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  32.14 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  29.32 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  29.69 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  31.45 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.63 
 
 		 398 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.63 
 
 		 398 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.63 
 
 		 398 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  30.13 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.25 
 
 		 489 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  31.01 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  27.34 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  31.33 
 
 		 462 aa  71.6  0.000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.28 
 
 		 476 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  27.34 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.25 
 
 		 470 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.75 
 
 		 480 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  34.43 
 
 		 212 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.25 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  34.38 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  24.81 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  32.56 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  27.63 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  23.49 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  26.09 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0345  siroheme synthase  25.69 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00442257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  32.81 
 
 		 464 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 528 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.09 
 
 		 800 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  28.97 
 
 		 472 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.97 
 
 		 472 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.33 
 
 		 394 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  28.97 
 
 		 472 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.74 
 
 		 447 aa  67.4  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  32.81 
 
 		 464 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  29.17 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  31.25 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  31.25 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  36.19 
 
 		 405 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  32.03 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  31.25 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  23.08 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  31.25 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.58 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  27.34 
 
 		 468 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  33.91 
 
 		 778 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.13 
 
 		 493 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  30.47 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  24.64 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  27.34 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  26.62 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.67 
 
 		 405 aa  63.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  27.34 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.07 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  30.53 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1155  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.13 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  27.7 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  30.37 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  28.77 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  26.19 
 
 		 255 aa  61.6  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.9 
 
 		 473 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  24.48 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  29.66 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  26.35 
 
 		 303 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  23.45 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2300  siroheme synthase  26.9 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000117051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  31.03 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.36 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  23.4 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.58 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  33.59 
 
 		 465 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>