83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2522 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  100 
 
 
339 aa  705    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  37.5 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
359 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  33.14 
 
 
355 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
368 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.66 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
359 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.62 
 
 
361 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  31.78 
 
 
333 aa  143  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
360 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
352 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
372 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
367 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  29.45 
 
 
384 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
364 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 
354 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
354 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
371 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  27.27 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  26.86 
 
 
1608 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25.31 
 
 
1444 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
924 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
1476 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  26.56 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
828 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  21.38 
 
 
1121 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
386 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
740 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
740 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  25.23 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  23.64 
 
 
398 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5020  hypothetical protein  37.97 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 
3172 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  31.82 
 
 
1147 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
360 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.55 
 
 
2401 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
390 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
428 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  21.45 
 
 
1192 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.98 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4434  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
430 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  23.67 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
421 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.34 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4205  Glycosyltransferase-like protein  33.75 
 
 
372 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 
1162 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  25.21 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4455  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
1188 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1672  glycosyl transferase group 1  46.67 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6506  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0135  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 
1213 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
953 aa  44.3  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.62 
 
 
1191 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
401 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  23.53 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
404 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
416 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
414 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 
1190 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
387 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 
427 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  20.77 
 
 
1187 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0986  hypothetical protein  27.22 
 
 
359 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
1292 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>