More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1733 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  100 
 
 		 144 aa  283  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  75.91 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  78.63 
 
 		 142 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  79.55 
 
 		 138 aa  210  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  76.34 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  75.76 
 
 		 132 aa  205  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  75.76 
 
 		 132 aa  205  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  76.34 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  76.92 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  75 
 
 		 132 aa  203  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  75.57 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  73.88 
 
 		 150 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  75.57 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  76.15 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  70.45 
 
 		 132 aa  200  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  75 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  73.48 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  78.23 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  69.47 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  73.48 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  72.18 
 
 		 137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  71.21 
 
 		 132 aa  193  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  69.92 
 
 		 347 aa  193  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.09 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  71.21 
 
 		 133 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  72.09 
 
 		 134 aa  190  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  71.21 
 
 		 133 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  68.94 
 
 		 151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  75.83 
 
 		 135 aa  187  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  81.2 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  76.67 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  78.63 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  67.69 
 
 		 334 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  76.92 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  76.92 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  74.36 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  59.23 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  64.17 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  57.25 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  60.47 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.46 
 
 		 318 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  48.84 
 
 		 313 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  46.09 
 
 		 310 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  46.51 
 
 		 315 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.62 
 
 		 320 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  44.19 
 
 		 314 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.74 
 
 		 315 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  38.17 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  46.67 
 
 		 312 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.19 
 
 		 314 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  46.21 
 
 		 320 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  44.19 
 
 		 316 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  43.41 
 
 		 314 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.41 
 
 		 316 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  43.41 
 
 		 314 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  39.37 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  45 
 
 		 314 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  38.58 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  38.58 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  39.52 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.69 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.54 
 
 		 302 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.58 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.78 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.78 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  39.52 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.78 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.41 
 
 		 313 aa  94  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.9 
 
 		 386 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.44 
 
 		 138 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.03 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  44.7 
 
 		 314 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  41.09 
 
 		 314 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  46.02 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  37.6 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  44.53 
 
 		 316 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  43.36 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 317 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  42.74 
 
 		 306 aa  90.9  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  40.62 
 
 		 400 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.27 
 
 		 321 aa  90.1  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  38.58 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  45.38 
 
 		 153 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  39.06 
 
 		 352 aa  89.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>