87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3563 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  30.49 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  25.53 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  23.39 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  24.44 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  22.54 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  22.54 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  26.24 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  24.66 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  25.4 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  23.81 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  24.07 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  22.83 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  26.7 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  22.83 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  23.96 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  25 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  22.89 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  22.03 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  22.57 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  23.12 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  28.06 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  23.26 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  21.57 
 
 		 295 aa  68.2  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  22.29 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  21.95 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  24.29 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  25.49 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.1 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  24.73 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  25 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  25.27 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  23.49 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  28.22 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  25.3 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  20.42 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  22.54 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  22.89 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  24.14 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  25.52 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  24.14 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  23.83 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  22.49 
 
 		 403 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  20.32 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  21.86 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  24.42 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  23.21 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  20.43 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  24.4 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  24.4 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  21.43 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  22.29 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  23.21 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  23.21 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  19.48 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  20.75 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  23.32 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  20.22 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  24.18 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  21.86 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  22.62 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  21.64 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  24.18 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  20 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  22.11 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  21.26 
 
 		 349 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  30.6 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  24.49 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  21.91 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  24.49 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  22.78 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  18.93 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  22.7 
 
 		 269 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  20.89 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  23.26 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  20.13 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  20.88 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  18.4 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  19.46 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.85 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  21.12 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  20.39 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  19.28 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  19.53 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  20.25 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  21.52 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>