226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3145 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3145  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
251 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.087939  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25489  predicted protein  32.63 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0283789 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27463  predicted protein  32.63 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00352572 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16807  predicted protein  35.94 
 
 
193 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15207  predicted protein  28.49 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.53 
 
 
156 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
188 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  33.64 
 
 
155 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
142 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
157 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
162 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
141 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
144 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
140 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
164 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 
153 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  30.7 
 
 
131 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  30.7 
 
 
131 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  30.84 
 
 
170 aa  52  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  26.09 
 
 
530 aa  52  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  31 
 
 
102 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
141 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  28.7 
 
 
137 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 
173 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
161 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
146 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  29.2 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  28.23 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  29.2 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  26.06 
 
 
169 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
138 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 
167 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.16 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 
181 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  27.42 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  24.19 
 
 
140 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  27.86 
 
 
143 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  31 
 
 
204 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
142 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  26.58 
 
 
153 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 
167 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  26.25 
 
 
181 aa  49.3  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 
167 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
168 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
158 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  29.25 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
143 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  33.33 
 
 
134 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  33.33 
 
 
134 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  25 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.33 
 
 
167 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  26.61 
 
 
153 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  25.36 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  32 
 
 
154 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  34.38 
 
 
96 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
179 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
136 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  31.82 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  30 
 
 
171 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 
162 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  31.88 
 
 
149 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  25.18 
 
 
153 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  31.88 
 
 
145 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  25 
 
 
473 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
129 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.07 
 
 
158 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.43 
 
 
159 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
177 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  30.12 
 
 
475 aa  45.8  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
315 aa  45.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
137 aa  45.4  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
184 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>