54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0105 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 403 aa  825    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  33.75 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  32.51 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  31.19 
 
 		 398 aa  219  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  32.2 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  31.76 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  31.05 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  31.02 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  31.28 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  31.28 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  31.28 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  33.57 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  30.27 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  31.28 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  31.53 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  31.53 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  31.77 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  31.77 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  32.2 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  31.28 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  31.63 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  31.13 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  30.52 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  28.5 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  24.57 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  24.21 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  26.46 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  22.81 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  24.04 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  24.55 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  24.62 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  23.8 
 
 		 392 aa  94  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  24.36 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  20.56 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  20.28 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  22.47 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  21.94 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  23.19 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  20.6 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  23.6 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  20.5 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  30.39 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  25.21 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  24.1 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  23.49 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  23.17 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  23.49 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  24.93 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  23.49 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  23.17 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  20.5 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  22.95 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02779  hypothetical protein  36.92 
 
 		 90 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000163075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  21.96 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>