More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3897 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
501 aa  1050    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
334 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
336 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
299 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
235 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
320 aa  94.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 
300 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
350 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
329 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
338 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
329 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
330 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 
282 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
1177 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  26.46 
 
 
340 aa  89.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
1177 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
321 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 
336 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
319 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
581 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
376 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
1035 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
1032 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
268 aa  87  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 
329 aa  87  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
316 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
344 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
303 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
302 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
293 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 
253 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
773 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1476 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 
278 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  36.67 
 
 
323 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
777 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.22 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  38.21 
 
 
306 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
260 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
280 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
317 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
337 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  38.21 
 
 
181 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.77 
 
 
642 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  27.07 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
847 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
313 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
310 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  28.7 
 
 
316 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
303 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
325 aa  79  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
339 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
750 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
316 aa  77  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.71 
 
 
324 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
340 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  25.86 
 
 
332 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.55 
 
 
295 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  37 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.35 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
930 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  24.05 
 
 
783 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  32.09 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.53 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.66 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  23 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.55 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>