121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1904 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  872    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  52.22 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  50.36 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  50.12 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  49.41 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 439 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  30.95 
 
 		 474 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  34.12 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  32.25 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  32.02 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  32.95 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 450 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  32.13 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  30.84 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 458 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  29.21 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 454 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  30.36 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  30.12 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  30.07 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  26.64 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  30.12 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  29.88 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  29.88 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  29.88 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  29.88 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  29.88 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  29.88 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 572 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  29.13 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  27.4 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  29 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  27.59 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  24.83 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  27.55 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 447 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  24.65 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  27.82 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  26.61 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  22.2 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  24.19 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  25.29 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  25.29 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 469 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 462 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0297  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.321668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 493 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 462 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  23.28 
 
 		 443 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  21.03 
 
 		 462 aa  90.1  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  22.85 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07437  Autophagy-related protein 22-1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW93]  27.7 
 
 		 588 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0083743  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07591  Autophagy-related protein 22-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVT9]  22.83 
 
 		 593 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  23.96 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 454 aa  86.3  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0586  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1217  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  20.52 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  24.37 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>