159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0477 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 320 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  60.32 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  58.73 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  60.95 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  52.7 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  50.16 
 
 		 316 aa  321  9.000000000000001e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  49.21 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  46.08 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  48.89 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  48.17 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  47.46 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  44.78 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  47.65 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  43 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  31.19 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  31.85 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  33.74 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  31.29 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  32.59 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.56 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  29.62 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  29.3 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  32.88 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  32.99 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  28.44 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.37 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  32.64 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  30.13 
 
 		 318 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  32.76 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  31.76 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.08 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  28.12 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  31.21 
 
 		 279 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  30.9 
 
 		 279 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  30 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  31.44 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  31.21 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  31.08 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  27.63 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  31.43 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  28.44 
 
 		 343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  29.35 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  30.54 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.76 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  32.29 
 
 		 279 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 279 aa  126  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.3 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  31.29 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  31.29 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  31.29 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  29.22 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  29.71 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  28.83 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  28.66 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  27.58 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  29.17 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  32.18 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  30.07 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  30.53 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  30.61 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  27.08 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.19 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  29.31 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.16 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  28.94 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  29.81 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  27.83 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  28.75 
 
 		 329 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  28.47 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.04 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  29.91 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  28.34 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  28.93 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  25.55 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  30.27 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  26.74 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.66 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  27.67 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  27.94 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  30.31 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  30.38 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  29.54 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  29.54 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  28.83 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>