More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0020 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
269 aa  535  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 
277 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  37.82 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  39.7 
 
 
277 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  38.15 
 
 
712 aa  159  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  34.72 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  35.13 
 
 
280 aa  135  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.99 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.23 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.23 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.57 
 
 
280 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  35.86 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
267 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
264 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.68 
 
 
341 aa  122  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.97 
 
 
263 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  32.4 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  30.22 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  32.4 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  32.4 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  35.23 
 
 
260 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  47.69 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.7 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 
280 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.75 
 
 
263 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 
268 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.98 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  33.02 
 
 
242 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  31.76 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.63 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  29.37 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  33.21 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  38.14 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  30.97 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  30.97 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  30.97 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 
279 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
265 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
261 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  33.83 
 
 
261 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  32.33 
 
 
303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  48.72 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.2 
 
 
275 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  32 
 
 
268 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  31.8 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  46.67 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.69 
 
 
285 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  40.32 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
269 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.35 
 
 
269 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  35.77 
 
 
274 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  39.52 
 
 
285 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 
284 aa  107  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  39.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 
285 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  39.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  39.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 
262 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  39.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  39.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  34.56 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
289 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  39.52 
 
 
249 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  31.03 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  39.52 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  32.34 
 
 
285 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  31.79 
 
 
304 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  36.32 
 
 
270 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  31.84 
 
 
310 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
285 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  43.8 
 
 
264 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 
270 aa  106  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>