More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0633 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  87.95 
 
 
249 aa  452  1e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  85.89 
 
 
249 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  87.15 
 
 
249 aa  444  1e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  84.68 
 
 
249 aa  437  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  83.06 
 
 
249 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  84.27 
 
 
249 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  84.68 
 
 
249 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  84.27 
 
 
249 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  79.03 
 
 
252 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  84.16 
 
 
221 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 
261 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  40.96 
 
 
267 aa  189  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  40.96 
 
 
267 aa  189  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  40.96 
 
 
267 aa  189  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  40.96 
 
 
267 aa  189  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  42.57 
 
 
261 aa  188  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  42.57 
 
 
261 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  42.57 
 
 
261 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  40.56 
 
 
267 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  40.7 
 
 
284 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  3.4912e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
261 aa  184  1e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  39.36 
 
 
259 aa  182  4e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  40 
 
 
295 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
261 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  43.9 
 
 
268 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.91412e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.6657e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.53459e-05  normal  0.415461 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.29495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.67391e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  40.4 
 
 
258 aa  179  3e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  41.77 
 
 
261 aa  179  3e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  39.76 
 
 
261 aa  179  3e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  41.77 
 
 
278 aa  178  6e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  41.86 
 
 
256 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  40.39 
 
 
267 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  7.75855e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  41.5 
 
 
256 aa  175  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 
261 aa  173  3e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
257 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
257 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
257 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  40.94 
 
 
254 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  40.39 
 
 
260 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  39.84 
 
 
257 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
257 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  37.21 
 
 
295 aa  164  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
261 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
262 aa  162  4e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
262 aa  162  4e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  39.41 
 
 
262 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  39 
 
 
271 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  34.4 
 
 
263 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  36 
 
 
260 aa  148  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.08011e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  32.8 
 
 
259 aa  148  1e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  34 
 
 
263 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
252 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  34.29 
 
 
247 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  42.05 
 
 
199 aa  131  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  35.91 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  32.21 
 
 
252 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
252 aa  81.3  1e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  31.96 
 
 
265 aa  73.2  3e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
256 aa  72.8  5e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  32.79 
 
 
252 aa  72  9e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  30.14 
 
 
245 aa  71.2  1e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
252 aa  70.5  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
270 aa  70.5  2e-11  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  30.52 
 
 
245 aa  70.5  3e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.2 
 
 
238 aa  68.6  1e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  34.29 
 
 
237 aa  66.2  5e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.86 
 
 
229 aa  65.9  6e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  1.65496e-07 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.94 
 
 
232 aa  65.9  7e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
249 aa  65.5  9e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.17 
 
 
247 aa  65.1  1e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.86 
 
 
232 aa  64.7  1e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.43556e-14  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
262 aa  63.5  3e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 
239 aa  63.2  3e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 
239 aa  63.5  3e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  62.8  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.85461e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.58 
 
 
246 aa  62.8  5e-09  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 
234 aa  62.4  6e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  31.46 
 
 
243 aa  61.2  1e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.38 
 
 
259 aa  61.2  2e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 
232 aa  61.2  2e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.51 
 
 
235 aa  61.2  2e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
244 aa  60.5  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.21 
 
 
254 aa  60.5  2e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.36 
 
 
232 aa  60.1  3e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 
232 aa  60.5  3e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 
237 aa  59.7  4e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.62 
 
 
246 aa  60.1  4e-08  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 
237 aa  59.7  4e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 
252 aa  59.7  4e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.91 
 
 
242 aa  59.7  4e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  33.5 
 
 
256 aa  59.7  5e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>