200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2304 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  100 
 
 
231 aa  477  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  65.97 
 
 
229 aa  276  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.93 
 
 
254 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  89.22 
 
 
128 aa  188  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  51.85 
 
 
139 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  31.41 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.92 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.72 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  42.7 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.22 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.14 
 
 
190 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.28 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  45.35 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  45.35 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  45.35 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  45.35 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  41 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  45.35 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  41 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  33.54 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  33.57 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  44.62 
 
 
104 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  36.27 
 
 
118 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  44.16 
 
 
104 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.78 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.95 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  38.95 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.95 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.79 
 
 
96 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.78 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  44.62 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.52 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45470  twin arginine-targeting protein translocase  54.32 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  40.51 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3049  twin-arginine translocation protein TatB  56.92 
 
 
122 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2658  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  56.92 
 
 
122 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  47.54 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  41.79 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  31.01 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  43.18 
 
 
126 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  31.01 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.31 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  31.01 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  31.67 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  41.79 
 
 
182 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  41.79 
 
 
175 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  46.43 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0742  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.25 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  35.96 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  50 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  42.62 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  42.62 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  44.64 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  44.64 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  34.44 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  42.62 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  34.44 
 
 
168 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  48.28 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.45 
 
 
155 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  45.9 
 
 
159 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  35.48 
 
 
125 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.28 
 
 
122 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  45.9 
 
 
164 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  45.9 
 
 
159 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  41.54 
 
 
157 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  45.9 
 
 
152 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  26.81 
 
 
142 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  40.3 
 
 
162 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  44.26 
 
 
154 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  36.36 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  46.88 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 
138 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.29 
 
 
140 aa  62.4  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  31.18 
 
 
133 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  40.98 
 
 
170 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  40 
 
 
125 aa  61.6  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  34.52 
 
 
154 aa  61.6  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  36.84 
 
 
160 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  40 
 
 
162 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.93 
 
 
173 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.73 
 
 
145 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  38.46 
 
 
132 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
99 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0517  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50 
 
 
113 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>