More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0326 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
423 aa  866  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  70.55 
 
 
422 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  69.91 
 
 
423 aa  621  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  71.09 
 
 
422 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.36944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  68.96 
 
 
422 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  68.48 
 
 
422 aa  613  1e-174  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55791e-12 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  69.83 
 
 
423 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  67.46 
 
 
422 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
424 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.07933e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  63.25 
 
 
424 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.27784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
424 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
424 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
424 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.51386e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
424 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.49119e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
424 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.83486e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
424 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
424 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
424 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
424 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  62.29 
 
 
424 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  63.59 
 
 
424 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  62.8 
 
 
427 aa  540  1e-152  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  2.14163e-06 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
424 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
423 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  60.61 
 
 
424 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  61.23 
 
 
427 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  60.9 
 
 
423 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
422 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  59.91 
 
 
425 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
424 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  59.02 
 
 
432 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
426 aa  514  1e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.08686e-07  hitchhiker  6.59657e-08 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
425 aa  514  1e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
420 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
425 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  59.81 
 
 
425 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  56.87 
 
 
423 aa  508  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
422 aa  508  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
423 aa  504  1e-142  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  59.43 
 
 
423 aa  506  1e-142  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
427 aa  504  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
427 aa  502  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 
421 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  56.98 
 
 
430 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 
425 aa  495  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
427 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
422 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.1419e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
426 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
423 aa  482  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.46844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
424 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
427 aa  475  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  55.69 
 
 
424 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
425 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
428 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.21115e-07  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
425 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
427 aa  470  1e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
428 aa  470  1e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
426 aa  468  1e-130  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 
428 aa  466  1e-130  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
426 aa  465  1e-130  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.59 
 
 
417 aa  467  1e-130  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1971  seryl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
427 aa  465  1e-130  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.140828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
428 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
428 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
428 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
428 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
428 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
423 aa  458  1e-128  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
428 aa  459  1e-128  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  4.82447e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
426 aa  459  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  8.44174e-05 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
427 aa  460  1e-128  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
426 aa  458  1e-128  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
428 aa  459  1e-128  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
428 aa  461  1e-128  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 
426 aa  460  1e-128  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3916  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
435 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 
428 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
428 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.08788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
428 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.45216e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
424 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
424 aa  455  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
426 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
435 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3994  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
435 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
426 aa  458  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
426 aa  452  1e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
428 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.18192e-05  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
426 aa  452  1e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
426 aa  453  1e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
428 aa  452  1e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  2.0455e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
429 aa  452  1e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
428 aa  454  1e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
427 aa  453  1e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 
428 aa  454  1e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
428 aa  454  1e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
426 aa  452  1e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
425 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  51.73 
 
 
433 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
433 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  51.97 
 
 
427 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.697706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>