54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0239 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 397 aa  807    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  52.64 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  33.67 
 
 		 399 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  33 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  35.5 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  34.51 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  34.26 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  34.26 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  34.01 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  33.92 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  33.33 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  33 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  32.33 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  32.51 
 
 		 401 aa  229  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  32.49 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  32.24 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  33.17 
 
 		 450 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  31.91 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  31.91 
 
 		 396 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  30.24 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  28.5 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  29.57 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  28.86 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  29.06 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  28.5 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  26.47 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  26.17 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  24.49 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  26.26 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  26.1 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  21.97 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  21.69 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  21.66 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  23.16 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  22.65 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  25.15 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  22.65 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  21.6 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  26.33 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  25 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  23.91 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  23.08 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  22.74 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  22.74 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  25.21 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  22.74 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  22.44 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  22.74 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  23.24 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  21.64 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  20.84 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  21.49 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  20.84 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  23.25 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>