More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0036 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  100 
 
 		 381 aa  759    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  77.63 
 
 		 403 aa  622  1e-177  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  72.97 
 
 		 385 aa  587  1e-167  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  75.96 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  49.06 
 
 		 409 aa  336  5e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  46.28 
 
 		 424 aa  236  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  37.85 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  36.16 
 
 		 371 aa  205  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  40.73 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  36.42 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  36.42 
 
 		 350 aa  193  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  40.67 
 
 		 489 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  39.67 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  40.17 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  33.63 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  36.93 
 
 		 439 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  37 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  37.36 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  41.16 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  38.22 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  38.22 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  38.52 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  36.62 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  35.96 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  38.74 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  36.44 
 
 		 512 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  35.5 
 
 		 436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  34.51 
 
 		 440 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  37.11 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  37.69 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  39.04 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  36.8 
 
 		 433 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  38.81 
 
 		 442 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.74 
 
 		 436 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  38.18 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  36.87 
 
 		 441 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  37.95 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  37.03 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  37.78 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  37.78 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  37.78 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  36.24 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  38.26 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  36.98 
 
 		 596 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  33.6 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  35.21 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.34 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  34.9 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  36.71 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  34.2 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  35.26 
 
 		 502 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  38.83 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  34.46 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  34.2 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  37.03 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  37.24 
 
 		 429 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  39.06 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.36 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  35.44 
 
 		 517 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  33.98 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  34.91 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  35.47 
 
 		 503 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  33.04 
 
 		 461 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  35.67 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  38.02 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  36.63 
 
 		 458 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  34.21 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  34.91 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  35.39 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  36.94 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  34.62 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  35.39 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  35.34 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  35.47 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  36 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  38.59 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  35.39 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  35.29 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  34.91 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  34.91 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  34.91 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  36.58 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  36.64 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  34.83 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  36.6 
 
 		 485 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  36.07 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  38.31 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  33.62 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  33.91 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  36.58 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  36.06 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.5 
 
 		 486 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  34.69 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  36.13 
 
 		 429 aa  169  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  35.71 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  35.78 
 
 		 406 aa  169  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  36.9 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  37.36 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  36.23 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>