278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2000 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  100 
 
 
285 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  95.44 
 
 
285 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  70.59 
 
 
279 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  64.68 
 
 
277 aa  349  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  63.53 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  64.66 
 
 
277 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  63.53 
 
 
292 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  64.23 
 
 
277 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.98 
 
 
288 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  38.89 
 
 
320 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  38.19 
 
 
320 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  39.51 
 
 
326 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  34.26 
 
 
308 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  36.82 
 
 
295 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  37.44 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  33.61 
 
 
305 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  35.47 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  36.16 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  25.18 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  29.21 
 
 
288 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  30.21 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  27.82 
 
 
284 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  27.17 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  35.43 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.25 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.13 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  31.88 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  36.46 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  30.09 
 
 
301 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  26.81 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  30.48 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  31.19 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  23.72 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  30.05 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  34.84 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  30.87 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  23.83 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  35.61 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  33.81 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  29.82 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.19 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  23.71 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  32.47 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  23.53 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  31.48 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  29.34 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  23.72 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.52 
 
 
370 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  28.09 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  32.86 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.96 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 
299 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  23.35 
 
 
319 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  23.98 
 
 
300 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 
270 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  40.23 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  37.36 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
240 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  21.46 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  37.36 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 
350 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  22.56 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
333 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  32.56 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  31.58 
 
 
314 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 
324 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 
324 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 
324 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.16 
 
 
324 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 
327 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  40.7 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.7 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>