More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3194 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  31.48 
 
 		 423 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  29.6 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  31.48 
 
 		 423 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  32.22 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.15 
 
 		 407 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.58 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.05 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  31.65 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  30.33 
 
 		 446 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  29.81 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.23 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.67 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  32.12 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  31.38 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.88 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 		 493 aa  146  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  29.06 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.6 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.48 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  30.62 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.08 
 
 		 423 aa  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.62 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  30.94 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  29.51 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.31 
 
 		 431 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.52 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.06 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.06 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.06 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  31.97 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.09 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.53 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.68 
 
 		 459 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  29.64 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  31.64 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.61 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  27.7 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.23 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  31.06 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.02 
 
 		 445 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  28.4 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  30.32 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.75 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.43 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  27 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  31.06 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.36 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.82 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.04 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.02 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  28.28 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  28.77 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.15 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  27.08 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29 
 
 		 402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  26.25 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.11 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  29.9 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  30.26 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  31.58 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.35 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.08 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  29.49 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  30.57 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  28.11 
 
 		 401 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.68 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.68 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  29.18 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.71 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  28.18 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.03 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  28.01 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.64 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  29.17 
 
 		 413 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.75 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.75 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.75 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  28.97 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  28.97 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  28.97 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  27.27 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.72 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  28.16 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  25.41 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.01 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  25.87 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  28.07 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  27.63 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  28.14 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.99 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  27.97 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  29.75 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  30.7 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  28.23 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  29.07 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  27.56 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  26.18 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  29.77 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.34 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>