More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0136 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  98.79 
 
 		 248 aa  490  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  97.58 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  97.58 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  88.38 
 
 		 248 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  87.97 
 
 		 248 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  84.62 
 
 		 248 aa  427  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  85.02 
 
 		 259 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  86.72 
 
 		 248 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  85.71 
 
 		 248 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.62 
 
 		 247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  84.62 
 
 		 242 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  83.76 
 
 		 244 aa  400  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.33 
 
 		 243 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  83.83 
 
 		 243 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.33 
 
 		 243 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.33 
 
 		 243 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  84.62 
 
 		 242 aa  401  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  64.98 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  55.37 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  53.66 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  55.83 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  53.85 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  54.43 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  52.05 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  54.01 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  51.64 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  51.64 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  51.23 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 228 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.69 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  47.26 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 224 aa  195  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  48.07 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  45.83 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  45.61 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.54 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.33 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.05 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 226 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 321 aa  184  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.73 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  45.02 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  44.98 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>