206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_49223 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  100 
 
 
336 aa  683    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  45.78 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  48.2 
 
 
334 aa  302  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  46.85 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  44.94 
 
 
339 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  46.13 
 
 
337 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  44.58 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  42.86 
 
 
336 aa  279  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  44.91 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  36.5 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  33.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  34.4 
 
 
346 aa  179  7e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  32.45 
 
 
346 aa  160  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  33.22 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  30.9 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
348 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  29.58 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  31.91 
 
 
328 aa  119  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  29.11 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  34.15 
 
 
363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  34.15 
 
 
363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
338 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
363 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
346 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  32.4 
 
 
357 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 
357 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  32.34 
 
 
340 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
355 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.11 
 
 
341 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
342 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.11 
 
 
341 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
341 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 
332 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
351 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
351 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
351 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
347 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
346 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  27.59 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  30.22 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  32.12 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  32.02 
 
 
322 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  30.58 
 
 
331 aa  94  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  27.25 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  31.47 
 
 
358 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  26.55 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  27.11 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.45 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  26.28 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 
352 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  29.07 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
341 aa  59.7  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  26.2 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  26.2 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26.84 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  25.91 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  25 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.22 
 
 
322 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 
339 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  26.06 
 
 
340 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  27.46 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  24.68 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  25.74 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.28 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 
320 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 
354 aa  52.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37466  predicted protein  25.25 
 
 
397 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  25.63 
 
 
342 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  25.9 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  26.47 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>